Vergleich von RSD-Screeningmethoden für Zuckerrohr und die tatsächlichen Diagnosekosten

Ratoon Stunting Disease (RSD) wird durch das Bakterium Leifsonia xyli subsp. xyli verursacht. Die Krankheit verursacht weltweit erhebliche Ertragseinbußen bei Zuckerrohrkulturen (Saccharum-Hybriden). Im Jahr 2022 wurden drei Diagnosetechniken zum Nachweis von RSD auf Feldern in der Zuckerrohrregion Herbert bewertet: qPCR (qualitative polymerase chain reaction) an Blattscheidenbiopsieproben (LSB-qPCR), qPCR an exprimiertem Xylemsaft und Phasenkontrastmikroskopie (PCM) an Xylempresssaft.

Die LSB-qPCR-Blattscheidenbiopsie wird aus der untersten grünen Blattscheide der Pflanze entnommen. Die Unterschiede zwischen den Techniken wurden in Bezug auf die Bestätigung des Vorhandenseins bzw. Nichtvorhandenseins von RSD, den Zeitaufwand für die Entnahme und Verarbeitung der Proben, die Kosten für die Probenahme, Sicherheitsaspekte und Transportkosten verglichen. Es wurden Unterschiede zwischen den drei Probenahmeverfahren hinsichtlich des RSD-Nachweises, der mit der Probenahme und -verarbeitung verbundenen Kosten und einiger sicherheitsrelevanter Aspekte festgestellt. Die LSB-qPCR war die effizienteste und kostengünstigste Diagnoseplattform für RSD.